Gennem årene har han skabt en del industrielle designs, blandt andet elektroniske instrumenter og fjernsyn for Bang & Olufsen, navigationsinstrumenter for SHIPMATE og forskellige insulin applikationer for Novo Nordisk A/S. Derudover deltog han også i udviklingen af det danske IC3 tog. Jens Møller-Jensen har ydermere arbejdet med grafisk design såsom vejskilte for det danske vejvæsen samt skilte for de Danske Statsbaner.
Hans mest berømte arbejde for Louis Poulsen er Albertslund lygten, som er blevet brugt i fire årtier i hele verdenen. Designet har også givet Jensen Den Danske Design Klassikerpris i 2000.
Siden 1995 har Jensens design været en del af udstillingen på Museum of Modern Art i New York. Hans arbejde er karakteriseret ved hans håndværk og hans evne til at arbejde med 3D, og ved at skabe de mest fantastiske 1:1 modeller, hvilket giver beslutningstageren en autentisk forståelse af produktet.
I dag er hans søn, Peter Møller-Jensen ansvarlig for designfirmaet, hvilket gør ham til den tredje generation af designer/arkitekt i familien.